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上海miRNA测序实验外包

miRNA 测序是研究特定组织在特定状态下的已知miRNA,分析预测新的miRNA,并对已知 miRNA 和新miRNA进行靶基因预测。通过对miRNA靶基因注释及代谢通路分析,将鉴定出的 miRNA与相应表型差异关联起来,为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力的工具。

上海miRNA测序实验外包生物信息分析内容

1、数据产出统计和质量评估

2、sRNA在参考基因组上的分布

3、sRNA分类注释统计

4、碱基偏好性分析

5、基因表达水平分析

6、新转录本预测

7、差异miRNA靶基因预测

8、差异基因筛选及聚类分析

9、差异表达miRNA靶基因GO富集分析

10、差异表达miRNA靶基因Pathway富集分析

11、差异表达miRNA靶基因蛋白互作网络分析

 

技术参数

样本类型:total RNA

样本要求:总量≥3 μg,浓度≥200 ng/μL

文库类型:Small RNA文库

测序策略:HiSeq SE50,推荐数据量:≥10M reads

项目周期:35个工作日

 

结果示例

样本已知miRNA各位置碱基偏好性

 

新miRNA二级结构及reads mapping示意图

 

各个样本之间共有novel miRNA分布

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